本分院自民國36年成立於青島匯泉，迄今已逾七十年，經過多次編制變革及更迭，民國95年由三軍總醫院承接改名為「三軍總醫院澎湖院區」，民國104年奉國防部令更銜為三軍總醫院澎湖分院，亦是澎湖老一輩口中所信任的「海軍醫院」。本分院平時除了負責澎湖地區醫療、戰時為第一作戰區聯合醫療中心，更是地區緊重症、重大災變及法定傳染病及產婦接生的主要醫療照護機構。本分院醫師、護理師、藥師等醫技人員均由國防部軍醫局及三軍總醫院遴選優秀派任，且具有豐富醫療經驗之醫護人員執行醫療服務相關任務，為在地10萬軍民提供醫學中心等級的優質醫療服務。

安裝三總澎湖分院APP「行動資訊服務系統」，讓您隨時隨地一手掌握就診資訊，包括看診進度、看診提醒、行動掛號、門診表、衛教新知、最新消息、醫療團隊介紹、交通資訊、電話快撥等服務，歡迎民眾踴躍下載使用。我們也將不定期提供系統功能升級與更新版本。